大家来看看这张图，就能明白环境微生物的关系有多复杂。通常情况下，细菌、真菌和病毒这些生物，它们不是孤立存在的，而是互相竞争、互相利用，甚至一起进化。如果把这些关系用一张“网络”来表示，节点代表微生物或者基因，边就表示它们之间的关系，就能够一眼看出谁跟谁关系好，谁跟谁有矛盾。网络的结构直接影响整个群落的功能：正相关边越多，合作就越多；负相关边越多，竞争就越激烈。 要读懂这个“朋友圈”，首先得把它画出来。我们可以用丰度表来做基础数据，系统会帮你比较几种不同的相关系数，比如Spearman、Pearson和Kendall，哪种更稳定就用哪种，最后呈现出来的就是有统计学意义的边。 接下来就是绘图了。点击一下按钮就能生成一张交互式网络。节点大小根据丰度调整，颜色可以自定义；边根据相关系数着色，正相关用红色表示，负相关用蓝色表示。如果把鼠标悬停在边上就能看到具体的数值。这样就能快速找到那些关系紧密的小伙伴或者竞争对手。 这张图比单纯看表格要高效直观多了。你能看到很多聚在一起的节点，它们通常执行同样的功能；有些节点度数很高，是整个群落中的关键人物。红色边多说明它们合作紧密，蓝色边多说明竞争激烈。 我就给大家演示一下怎么在生科云小程序上生成这个网络图。只要上传丰度表，选择好物种或者基因列表，勾选一下网络分析模块，然后等待5秒就行了。整个过程只要30秒就能搞定。这个操作不需要安装任何软件或者写脚本。 未来这个平台还会更新更多工具，比如单细胞测序、宏基因组等数据分析模块也会陆续上线。关注更新信息就能把最新数据转化成可视化的图谱。