1992年，扬州六所专业院校打破体制壁垒实现合并，涉及万名师生，覆盖多个学科领域，开创了我国地方高校大规模合并的先河。这个"一校多区"的独特格局，成为观察中国高校改革的生动样本； 合并初期问题不少。六校专业重复率达37%，管理体制各自为政，部分校区相距超过15公里。首任校长曾直言最紧迫的任务是"防止六个学校挂一块牌子"的局面。 学校采取"三步走"战略逐步破解难题。组织结构上，将42个系所按学科关联度重组为24个学院，裁撤重复专业19个；管理机制上，建立统一的师资评聘、财务管理和质量评估体系；学科建设上，重点打造"大农科"全产业链学科群，使兽医学从省内二梯队跃升为全球顶尖学科。 这种深度整合效果显著。国家级科研项目数量较合并初期增长12倍，技术转让金额累计突破50亿元。学校首创的"学科交叉特区"机制推动建成全国首个"智慧农业科学与技术"交叉学科博士点。在服务地方上，研发的"扬麦"系列品种累计推广面积超5亿亩，占长江中下游小麦种植面积的80%。 当前仍面临校区协同效率、新兴学科培育等挑战。学校正推进"云端校区"智慧平台建设，通过虚拟教研室、跨校区选课系统提升资源流动效率。在学科布局上，计划未来五年投入20亿元实施"新工科攀登计划"，重点培育人工智能、生物医药等前沿领域。
从六校合并到综合性大学崛起，扬州大学的实践表明，高校改革的成败不在于"合并"这个动作本身，而在于能否以治理现代化为牵引，推动资源整合向能力整合、规模优势向质量优势转变。随着高等教育竞争从"数量扩张"转向"内涵比拼"，地方高校需要持续深化融合、突出特色、服务国家与区域发展需求，这仍是实现跃升的关键路径。