核酸提取纯化有这5种方案,各有各的优缺点,选对了能保证后续实验的顺利进行。要记得DNA、RNA还有HBV、HIV这类病毒都得分别处理,不能混在一起。回收的核酸得够多,浓度还得稳定,才能满足PCR和测序的需求。 苯酚氯仿抽提法,算是经典的方法。它靠苯酚让蛋白质变性,SDS和蛋白酶K帮忙分解蛋白质。反复这么抽提几次,DNA就被赶到上层水相里了,蛋白质则留在有机相。优点是试剂便宜,大家实验室都有条件做;缺点是苯酚和氯仿毒性大味儿难闻,操作细节不注意容易丢核酸。 离心柱法也很受欢迎。把样品过柱子的时候,核酸会被亲水膜吸附住。把盐浓度调低再换成洗脱液一冲,核酸就下来了。这种方法操作简单省心。但它有个毛病:膜结合力会受盐离子影响,洗脱时体积和次数得调对;要是提取量太大,膜容易饱和导致核酸跑光;还有直接拿去做PCR可能不太够劲儿。 磁珠法就像用带静电的珠子抓粉笔一样。磁珠带着正电能把带负电的核酸吸住,一加磁场就能快速抓取。洗干净再换缓冲液把磁珠弄起来,核酸也就洗脱下来了。它特别适合搞高通量的临床诊断,比如处理血清血浆之类的液体样本,还有测HIV、HBV这类病毒基因的时候用得上。不过对低浓度的核酸敏感性差点意思,做检测前最好先扩增富集一下。 还有那种快速释放技术简直就是懒人福音。不用苯酚氯仿那些复杂东西,直接在一管子里反应3分钟就能拿到PCR模板。全封闭还防交叉污染,适合现场快速检测或者床旁诊断那种特别急的情况。缺点就是一次只能弄一个样,要是批量处理还得自己动手分装。 到底选哪个方案?得看你是做液体还是固体样本:液体一般用磁珠法比较稳妥;固体样本用苯酚抽提或者那个快速释放技术也可以。目标核酸量少的话就选快速释放;要弄很多的话就得离心柱加大点体积来搞。 下游要是要用PCR做实验,得挑那种回收率高又没杂质的方案;要是要做NGS测序,还得做进一步的纯化和浓度测定才行。实验条件上要是有通风橱就不怕用苯酚抽提法;要是想省事儿或者自动化点做实验就选磁珠法或者试剂盒优先考虑。 总之把这五条原则记在心里,再对比下每个方案的优缺点和你的具体需求,就能在这四种方法里迅速选出最适合你自己的那一个了。