问题——长期以来，弄清转录因子如何在全基因组范围内“选择”结合位点并调控基因表达，是生命科学与农业育种研究中的基础任务。传统ChIP-seq虽然应用广，但实际操作对特异性抗体、材料获取和遗传操作体系依赖较强：不少物种缺少可用抗体，遗传转化体系难以建立或周期过长；取样也常受组织类型、发育阶段和处理时间窗限制。这些因素叠加，使园艺作物、中草药以及部分水产、昆虫等非模式物种的转录调控网络研究推进缓慢，影响功能基因挖掘与性状改良效率。
从依赖抗体与复杂材料体系的传统路线，转向更具普适性的体外高通量解析，DAP-seq代表了生物技术路径的“降低门槛”与“提高效率”；在气候变化与产业需求的推动下，能够跨越物种壁垒、快速解析调控网络的工具，将更好连接基础研究与育种应用，也为我国丰富生物资源的深入开发与利用提供新的方法支撑。